Трагическая история крупнейшего морского собора времен правления Российской империи уходит своими корнями к началу XIX века, когда многократные попытки поднять вопрос о его строительстве в Кронштадте оставались безуспешными. И лишь в 1897 году адмиралу Николаю Ивановичу Казнакову удалось получить разрешение на сбор средств для долгожданного строительства православной обители.

Воздвигнуть грандиозный храм, проект русского архитектора Василия Антоновича Косякова, было решено на просторной Якорной площади, где лежали старые якоря. Кроме того, там было достаточно места для разбивки соборного парка, а высокие купола служили своеобразным ориентиром для мореплавателей. Торжественная закладка первого камня состоялась в присутствии российского императора Николая II и членов императорской семьи. В тот день прогремел 31 выстрел в честь основания храма, а в парке были посажены первые 32 дуба. Спустя десять лет состоялось торжественное освящение Морского собора святителя Николая Чудотворца. Но уже через несколько лет храм был закрыт, купола и кресты сброшены, а росписи и мозаики закрашены. Пострадало и богатое внутреннее убранство и церковная утварь, были разрушены старинные иконы и мраморный иконостас, а внутри был открыт кинотеатр имени Горького.

О годах Великой Отечественной войны громче слов говорит след от немецкой бомбы, который можно увидеть и в наши дни в северной части храма. Не вернули святыню верующим и после окончания войны. В середине XX века на его территории работал концертный зал, чей роскошный интерьер с византийским орнаментом украшает собор и в настоящее время. Лишь в начале XXI века в Морском Никольском соборе возобновились религиозные службы, на колокольне установили православный крест, а храму передали икону Воскрешения Лазаря и частицы мощей святителя Николая Чудотворца и двенадцати апостолов.

Сегодня величественный собор в неовизантийском стиле является истинным символом Кронштадта, одной из главных достопримечательностей Санкт-Петербурга и главным храмом Военно-морского флота России.