Depuis le XVIe siècle, des centaines de moines venaient dans la ville de Santiago de Querétaro et y construisaient leurs cathédrales et monastères. Au début, c’étaient des franciscains, puis des jésuites, de sorte que la ville est devenue peu à peu une « grande paroisse ». Mais aujourd’hui, le sanctuaire principal de la ville est la cathédrale de Santiago de Querétaro.
La construction du sanctuaire a commencé à la fin du XVIIIe siècle par des membres de l’ordre monastique oratorien. 20 ans plus tard, sa grande ouverture et sa consécration ont eu lieu en l’honneur du Saint-Philippe Néri. Selon certaines sources, la cathédrale a été consacrée par Miguel Gregorio Antonio Ignacio Hidalgo y Costilla y Gallaga Mondarte Villaseñor, un prêtre catholique mexicain et héros révolutionnaire national qui a déclenché la guerre d’indépendance du Mexique contre les autorités espagnoles. Il a également tenu la première messe ici.
La cathédrale catholique est une grande structure religieuse avec une nef, un dôme et une tour. Le fait qu’elle ait été construite pendant la période coloniale est attesté par la combinaison de plusieurs styles architecturaux du baroque au néoclassicisme. Toute la décoration extérieure était faite du matériau traditionnel de cette région — de la pierre rouge d’origine volcanique. La façade du bâtiment est richement décorée de diverses sculptures, des bas-reliefs et des éléments décoratifs de style baroque. Une place spéciale est occupée par le bas-relief de Saint-Philippe Néri qui protège des croyants avec son manteau.
L’intérieur de la cathédrale est tout le contraire et est présenté dans un style néoclassique pur. Il abrite de belles œuvres de sculpteurs renommés de l’État de Querétaro, ainsi que des peintures du célèbre peintre mexicain Miguel Mateo Maldonado y Cabrera. Le plafond incroyablement beau de la sacristie de la cathédrale mérite une attention particulière.
La place centrale de la cathédrale appartient à l’autel principal qui abrite le groupe sculptural des apôtres Juan, Pablo et Santiago qui est le saint patron de la cathédrale et du diocèse de Querétaro, ainsi qu’une excellente croix sculptée.
Malgré le fait que le statut de la cathédrale ait été accordé au sanctuaire par le pape Benoît XV en 1922, en fait, sa consécration a eu lieu le 30 juin 1931 par l’évêque de Querétaro Francisco Banegas y Galván.