C'est difficile à imaginer, mais dans la deuxième plus ancienne des églises catholiques du Vatican, comme il y a plusieurs siècles, des services religieux sont organisés, bien que la plupart de ses visiteurs soient aujourd'hui des touristes. Et ce n'est pas surprenant, car un sanctuaire aussi ancien attire l'attention du monde entier non seulement avec son architecture, mais aussi avec des intérieurs uniques décorés de fresques originales.

L'histoire de l'église San Pellegrino du Vatican a commencé à l'époque du pape Léon III à la fin du VIIIe siècle. Initialement, elle faisait partie du complexe de bâtiments qui entourait la basilique Saint-Pierre. Construit sur le site de l'ancien stade de Naumachie, où les gladiateurs organisaient des batailles navales, le modeste sanctuaire catholique a été nommé l'église San Pellegrino de Naumachie. Plus tard, elle a perdu une partie de son nom, mais a conservé pour les futurs descendants son aspect d'origine, réalisé dans le style de la Renaissance carolingienne. Ceci est particulièrement visible sur les niveaux supérieurs du sanctuaire, dont les murs sont revêtus de briques typiquement carolingiennes.

Selon une ancienne légende, l'église a reçu son vrai nom en 800, après que Charlemagne ait offert au sanctuaire un cadeau généreux en l'honneur de son couronnement. Le don impérial représentait les reliques de saint Pérégrin, d'où le nom de l'église. Chaque chef de l'Église catholique romaine s'efforçait également d'apporter sa généreuse contribution à la décoration intérieure. Le pape Léon III a présenté une lampe en argent, qui est aujourd'hui la principale relique de l'église San Pellegrino.

Actuellement, les fresques représentant les figures du Christ, des saints Pierre et Paul et d'autres apôtres, datant du XIVe siècle, sont considérées comme la véritable fierté de l'ancien sanctuaire. Bien que, selon certaines études, la figure du Christ remonte même à une période antérieure, au milieu du IXe siècle, tandis que d'autres images ont été ajoutées plus tard. Ceci est également attesté par la manière de réaliser son image, caractéristique des Carolingiens.