Lorsque le gouverneur de Tomsk a reçu un décret sur la création de l'Université de Sibérie, ce dernier comprenait également la création d’un jardin botanique universitaire, qui nécessitait aussi de territoire. Ce territoire de 1,7 hectares a été réservé dans la partie sud du futur site du complexe universitaire.
Ainsi l’histoire de cette réserve naturelle étonnante, qui est la plus ancienne de Sibérie. Jusqu'au milieu du XX siècle et l’ouverture du jardin botanique de Novossibirsk elle était également la plus grande.
En 1885, Porfiri Nikítich Krylov, un jardinier scientifique de Kazan, a apporté environ 60 espèces de plantes au jardin botanique. Bien que la plupart de ces espèces étaient de courte durée, certaines d'entre elles étaient des centenaires. Ces plantes ont le même âge que le jardin et ravissent encore les visiteurs. Parmi elles vous trouverez le ficus radicans, la kentia et le bunya-bunya, dont l'âge est d’environ 130 ans.
En 1888 (à l’ouverture de l’université), le Jardin botanique de Sibérie occupait 1,2 hectares, tandis que son orangerie avec trois branches occupait 473 mètres carrés.
En outre, le jardin contenait une serre au toit en bâtière d’une superficie de 93 mètres carrés, et une collection de plantes médicinales, ligneuses, arbustives et herbacées poussait également sur un sol ouvert.
En plus du jardin lui-même, Krylov a fondé une orangerie. Elle se trouve dans le bosquet de l'université et comprend un parc autour du bâtiment principal de l'établissement d'enseignement. Les étudiants adorent cet endroit, parce que c’est une excellente façon de récupérer les forces dans un cadre naturel parmi les plantes et les écureuils. Il y a aussi un parc paysager, qui possède une belle roseraie et d’autres formes d’art du jardin.
Le jardin botanique dispose actuellement plus de 6000 espèces de plantes dans la collection et deux zones, l’une près de l’Université et l'autre entre deux quartiers résidentiels à la sortie de la ville. Leur superficie totale est de plus de 120 hectares, tandis que l’orangerie principale est l’une des plus élevées en Russie et dans le monde avec une hauteur de 31 mètres.